University of Virginia
细菌生物信息学
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细菌生物信息学

Rebecca Wattam

位教师:Rebecca Wattam

21,213 人已注册

深入了解一个主题并学习基础知识。
4.7

(281 条评论)

中级 等级

推荐体验

1 周 完成
在 10 小时 一周
灵活的计划
自行安排学习进度
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您将学到什么

  • 学习如何组装细菌基因组

  • 学习如何注释细菌基因组

  • 学习如何从一组细菌基因组生成系统发生树

  • 学习如何对一组细菌基因组进行基本的比较分析

要了解的详细信息

作业

8 项作业

授课语言:英语(English)

了解顶级公司的员工如何掌握热门技能

Petrobras, TATA, Danone, Capgemini, P&G 和 L'Oreal 的徽标

该课程共有8个模块

本课介绍 BV-BRC,即细菌和病毒资源整合中心(前身为 PATRIC),这是一个致力于支持细菌研究的生物信息资源中心。BV-BRC 提供全面的细菌基因组数据,并集成了分析工具和可视化工具。BV-BRC 还提供了一个私人工作空间,用户可以上传和分析自己的数据。请注意,这些练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过,BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的,因此大部分内容仍然相同。

涵盖的内容

7个视频1个作业

本课提供了使用 BV-BRC 基因组组装服务从一组细菌序列读数组装基因组的分步指导。请注意,这些练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过,BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的,因此大部分内容仍然相同。

涵盖的内容

7个视频1个作业

本课提供了使用 BV-BRC 细菌基因组注释服务(BV-BRC Bacterial Genome Annotation Service)从等位基因注释基因组的分步说明。请注意,这些练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过,BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的,因此大部分内容仍然相同。

涵盖的内容

7个视频1个作业

本课将逐步介绍如何使用 BV-BRC 基因组综合分析服务(BV-BRC Comprehensive Genome Analysis Service)对一组细菌序列读数进行基因组组装、注释和自动分析。请注意,这些练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过,BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的,因此大部分内容仍然相同。

涵盖的内容

10个视频1个作业

本课将逐步说明如何使用 BV-BRC 密码树服务从一组基因组中生成基于密码子的系统树。请注意,这些练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过,BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的,因此大部分内容仍然相同。

涵盖的内容

9个视频1个作业

本课将逐步说明如何使用 "相似基因组查找服务"(Similar Genome Finder Service)在 BV-BRC 中查找与您的基因组或序列相似的基因组(及相关分类)。 请注意,这些练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过,BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的,因此大部分内容仍然相同。

涵盖的内容

4个视频1个作业

本课将逐步说明如何使用 BV-BRC 蛋白质家族分类器(BV-BRC Protein Family Sorter)比较一组基因组中蛋白质家族中蛋白质的存在、缺乏和数量。请注意,这些练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过,BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的,因此大部分内容仍然相同。

涵盖的内容

13个视频1个作业

本课将逐步说明如何使用 BV-BRC 蛋白质组比较服务将一组基因组与参考基因组、特征组或 FASTA 文件进行比较。请注意,这些练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过,BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的,因此大部分内容仍然相同。

涵盖的内容

11个视频1个作业

位教师

授课教师评分
4.8 (106个评价)
Rebecca Wattam
University of Virginia
1 门课程21,213 名学生

提供方

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Felipe M.
自 2018开始学习的学生
''能够按照自己的速度和节奏学习课程是一次很棒的经历。只要符合自己的时间表和心情,我就可以学习。'
Jennifer J.
自 2020开始学习的学生
''我直接将从课程中学到的概念和技能应用到一个令人兴奋的新工作项目中。'
Larry W.
自 2021开始学习的学生
''如果我的大学不提供我需要的主题课程,Coursera 便是最好的去处之一。'
Chaitanya A.
''学习不仅仅是在工作中做的更好:它远不止于此。Coursera 让我无限制地学习。'

学生评论

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已于 Feb 6, 2024审阅

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已于 Apr 4, 2025审阅

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已于 Feb 4, 2022审阅

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