在这个毕业设计课程中,我们将比较 COVID-19 基因突变的基因组序列,以确定药物疗法的潜在靶区。药物发现的第一步是确定其基因组的目标子序列。我们将首先比较病毒变异的基因组,寻找相似之处。然后,我们将执行 PCA 来减少维数,并找出最常见的特征。接下来,我们将使用 Python 中的 K-means 聚类来找到最佳的组数,并追踪病毒的血统。最后,我们将预测序列之间的相似性,并以此挑选目标子序列。在整个课程中,每节课都会有一个编程任务,并配有指导视频和帮助提示。课程结束时,您将能够很好地利用基因组测序发现对抗疾病的方法。


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积累特定领域的专业知识
- 向行业专家学习新概念
- 获得对主题或工具的基础理解
- 通过实践项目培养工作相关技能
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该课程共有4个模块
在本模块中,我们将通过执行一些基本的 EDA 和比较基因组序列来开始熟悉我们的数据集。通过分析 COVID-19 病毒的突变,我们将能够确定我们的药物应该针对的基因组的一些共同特性。
涵盖的内容
4个视频1个编程作业1个讨论话题1个非评分实验室
在本模块中,我们将继续处理基因组序列数据--使用 PCA 来识别分组并找出最重要的特征。在减少数据集的维数后,我们将能够使用 K-means 形成聚类,并在二维空间中可视化不同的区域。
涵盖的内容
2个视频1篇阅读材料1个编程作业1个非评分实验室
在本模块中,我们将使用 K-means 算法对基因组序列进行聚类。我们将通过比较各种输入的剪影得分来优化聚类的数量,从而找出最大的落差。最后,我们将在最后一个模块中使用预测管道来预测比特分数和药物疗法。
涵盖的内容
2个视频1个编程作业1个讨论话题1个非评分实验室
在本模块中,我们将测试各种回归因子,看看哪种回归因子在预测每个基因组序列的位点得分方面表现最佳。然后,我们将使用所选模型找到关系最密切的基因组马属动物,并追踪出可能的子序列,以便使用对抗性药物。
涵盖的内容
2个视频1个编程作业1个非评分实验室
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人们为什么选择 Coursera 来帮助自己实现职业发展




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